Под слоем клеток, образующих корневые волоски, располагаются более глубокие слои клеток, составляющие основные ткани корня. Эти слои включают корневую кору, состоящую из паренхимных клеток, которые играют важную роль в хранении питательных веществ и воды, а также обеспечивают газообмен. Под корневой корой располагается эндодерма — специализированный слой клеток, который окружает центральный цилиндр, и участвует в регуляции поступления воды и минералов в сосудистую систему корня.
Внутри центрального цилиндра находится сосудистая ткань, представленная ксилемой и флоэмой, которая обеспечивает транспорт воды, минералов и органических веществ по растению. Ксилема осуществляет подъем воды и растворенных в ней минералов из почвы к надземным частям растения, а флоэма переносит органические вещества, такие как сахара, из листьев к остальным частям растения.
В центральной части корня также находится камбий, который отвечает за рост корня в толщину, а также перицикл — слой клеток, из которых могут развиваться боковые корни.